Le Congrès régional triennal est l’instance suprême de l’AFPC-Québec. Lors de chaque congrès, les déléguées et délégués syndicaux débattent les résolutions sur les finances, les statuts et des sujets généraux. C’est également lors de cette assemblée que les délégués syndicaux élisent la vice-présidente exécutive régionale ou le vice-président exécutif régional (VPER) ainsi que sa suppléante ou son suppléant. Chaque Congrès régional peut également adopter des résolutions qui seront soumises au Congrès national.
Le prochain Congrès régional triennal de l’AFPC-Québec aura lieu en avril 2017 à Mont Saint-Sauveur dans les Laurentides.